根據2014年2月18日行政院農業委員會公告漁業法規修正第4條，臺灣的漁港共分成二類：
第一類漁港乃使用目的屬於全國性或配合漁業發展特殊需要者，主管機關為行政院農業委員會；
其他不屬於第一類漁港的則歸於第二類漁港，主管機關為當地縣、市政府。
據漁業署當前規劃，目前第一類漁港共有9處，分別是
基隆市正濱漁港、基隆市八斗子漁港，宜蘭縣烏石漁港、宜蘭縣南方澳漁港，
新竹市新竹漁港，臺中市梧棲漁港，高雄市前鎮漁港，屏東縣東港鹽埔漁港，
第二類漁港則有215處。
已經廢止的舊制中，臺灣的漁港共分成四類，
第一類漁港使用範圍為全臺灣（全臺、遠洋漁業），共12個，
第二類漁港是屬於區域性（近海漁業），共11個，
第三類漁港為地方性（沿岸漁業），共117個，
第四類漁港主要是離島或偏遠地區的作業漁船避風港（臨時停泊或避風），共99個。
全國總計共有239個漁港。
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